Rのいんすとーる
をテンプレートにして作成
開始行:
#contents
*2013年11月23日 [#dc96cd9d]
**パッケージ(ライブラリ)のインストール先の設定(Windows...
GUI版で使うだけならデフォルトのままで問題はなかったのです...
cygwin shell から rscript で R を使うときに、library の指...
きちんとしていないと、インストールした library が使えない...
rscript に引数渡しをしなければならないようだ。
これは面倒なので、library ディレクトリをひとつにしてしま...
そこで、GUI版の library のインストールディレクトリを設定...
後からインストールするパッケージが全て library ディレクト...
-ショートカットアイコンを右クリック
-プロパティを開く
-リンク先(T)を変更(「R_LIBS=」を追加)
-libraryディレクトリのプロパティをフルコントロールにする...
プロパティの変更したところ
旧: "C:\Program Files (x86)\R\R-2.10.1\bin\Rgui.exe"
新: "C:\Program Files (x86)\R\R-2.10.1\bin\Rgui.exe" R_...
cygwin shell から使うときに library の directory
を指定するという手もあるのだろうけれども、
アップデートのときのメンテナンスを容易にするためにも、
気にするディレクトリはひとつのほうがいいだろうと思ったの...
Windows に特化したワザが必要というのが何とも悔しい気も……。
http://cse.niaes.affrc.go.jp/miwa/ja/R/packages/index.htm...
**Windows版のアップデート [#w95e03ad]
-新しいバージョンをインストール
-ライブラリディレクトリを旧から新にコピー(新しいものだけ)
-GUI版Rからパッケージのアップデートを行う(パッケージ→パ...
http://d.hatena.ne.jp/bob3/20120520 を参考にしました。
*2011年6月3日 [#p9a28069]
普段使いのノートパソコンを働かせ続けると不便なので、
大学のサーバでRを使いたくなった。
しかし、デフォルトではインストールされていないので、
home directoryにインストールした。
のめもらんだむです。
**OSはSUSE Linux [#q4b369c3]
マシン:仮想サーバ
OS:
SUSE Linux Enterprise Server 11 (x86_64)
VERSION = 11
PATCHLEVEL = 0
「/etc/SuSE-release」より
sshでログインして操作する。~
よってX Window環境などは不要。~
グラフを作るだけなら、ノートパソコンのウィンドウズでそん...
**インストール [#a7ae766f]
http://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/linux/?R
を参照しました。
˜/myR> にインストールしました。
~/myR>ftp http://cran.md.tsukuba.ac.jp/src/base/R-2/R-2....
~/myR>tar xvzpf R-2.13.0.tar.gz
~/myR>cd R-2.13.0
~/myR/R-2.13.0>./configure --with-x=no --prefix=$HOME --...
* --with-x=no:Xは使わない(実際は使えない)
* --prefix=$HOME:一般ユーザとしてhome directoryにイン...
* 以上の2つは、奥村先生のページのインストラクションの...
※ 「--with-readline=no」を付けないとconfigureエラーにな...
~/myR/R-2.13.0>make
~/myR/R-2.13.0>make install
~/myR/R-2.13.0>make check
※ ちょっと時間が掛かる
「[test-Internet]Error 2 (ignored)」と出たが問題なさそう
**動作テスト [#jf8470b8]
~/myR/R-2.13.0>cd ..
~/myR>mkdir
~/myR>cd rwork
~/myR/rwork>R
※Rが動いた!
> mydata <- matrix( c(4,6,3,4), nr=2)
> fisher.test( mydata )
ちゃんと計算してくれた。よしよし。
しかし……、Back space キーが使えない。~
これは「--with-readline=no」を付けて configure → make し...
**動作テストその2 [#pd454b7c]
下のようなRコマンドファイル(mytest.R)を作る
sink("out.txt")
mydata <- matrix( c(4,6,3,4), nr=2)
fisher.test( mydata )
sink()
source()で読み込んで実行
> source("mytest.R")
out.txtは空っぽ。~
う〜ん、source()がこれまでと同じようには上手く動かない。~
バージョンの違い?それともウィンドウズ用との違い?
mydata と打ち込むとデータが表示されるので、読み込んではい...
ファイル入出力操作かコンソールへの表示に問題あり。
解決策:「echo=TRUE」を付けるとよさそう。((http://www.oka...
> source("mytest.R", echo=TRUE)
とすれば、ファイルに出力されるのを確認。
とりあえず、これで最低限のチェックはできた、と思う。
*2011年6月15日 [#xfb01645]
**バックグラウンドで実行 [#y03249e0]
奥村先生のページ http://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat...
nohup R CMD BATCH hoge.R &
出力は hoge.Rout にされます。
|Today:&counter(today); |Yesterday:&counter(yesterday); |...
終了行:
#contents
*2013年11月23日 [#dc96cd9d]
**パッケージ(ライブラリ)のインストール先の設定(Windows...
GUI版で使うだけならデフォルトのままで問題はなかったのです...
cygwin shell から rscript で R を使うときに、library の指...
きちんとしていないと、インストールした library が使えない...
rscript に引数渡しをしなければならないようだ。
これは面倒なので、library ディレクトリをひとつにしてしま...
そこで、GUI版の library のインストールディレクトリを設定...
後からインストールするパッケージが全て library ディレクト...
-ショートカットアイコンを右クリック
-プロパティを開く
-リンク先(T)を変更(「R_LIBS=」を追加)
-libraryディレクトリのプロパティをフルコントロールにする...
プロパティの変更したところ
旧: "C:\Program Files (x86)\R\R-2.10.1\bin\Rgui.exe"
新: "C:\Program Files (x86)\R\R-2.10.1\bin\Rgui.exe" R_...
cygwin shell から使うときに library の directory
を指定するという手もあるのだろうけれども、
アップデートのときのメンテナンスを容易にするためにも、
気にするディレクトリはひとつのほうがいいだろうと思ったの...
Windows に特化したワザが必要というのが何とも悔しい気も……。
http://cse.niaes.affrc.go.jp/miwa/ja/R/packages/index.htm...
**Windows版のアップデート [#w95e03ad]
-新しいバージョンをインストール
-ライブラリディレクトリを旧から新にコピー(新しいものだけ)
-GUI版Rからパッケージのアップデートを行う(パッケージ→パ...
http://d.hatena.ne.jp/bob3/20120520 を参考にしました。
*2011年6月3日 [#p9a28069]
普段使いのノートパソコンを働かせ続けると不便なので、
大学のサーバでRを使いたくなった。
しかし、デフォルトではインストールされていないので、
home directoryにインストールした。
のめもらんだむです。
**OSはSUSE Linux [#q4b369c3]
マシン:仮想サーバ
OS:
SUSE Linux Enterprise Server 11 (x86_64)
VERSION = 11
PATCHLEVEL = 0
「/etc/SuSE-release」より
sshでログインして操作する。~
よってX Window環境などは不要。~
グラフを作るだけなら、ノートパソコンのウィンドウズでそん...
**インストール [#a7ae766f]
http://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/linux/?R
を参照しました。
˜/myR> にインストールしました。
~/myR>ftp http://cran.md.tsukuba.ac.jp/src/base/R-2/R-2....
~/myR>tar xvzpf R-2.13.0.tar.gz
~/myR>cd R-2.13.0
~/myR/R-2.13.0>./configure --with-x=no --prefix=$HOME --...
* --with-x=no:Xは使わない(実際は使えない)
* --prefix=$HOME:一般ユーザとしてhome directoryにイン...
* 以上の2つは、奥村先生のページのインストラクションの...
※ 「--with-readline=no」を付けないとconfigureエラーにな...
~/myR/R-2.13.0>make
~/myR/R-2.13.0>make install
~/myR/R-2.13.0>make check
※ ちょっと時間が掛かる
「[test-Internet]Error 2 (ignored)」と出たが問題なさそう
**動作テスト [#jf8470b8]
~/myR/R-2.13.0>cd ..
~/myR>mkdir
~/myR>cd rwork
~/myR/rwork>R
※Rが動いた!
> mydata <- matrix( c(4,6,3,4), nr=2)
> fisher.test( mydata )
ちゃんと計算してくれた。よしよし。
しかし……、Back space キーが使えない。~
これは「--with-readline=no」を付けて configure → make し...
**動作テストその2 [#pd454b7c]
下のようなRコマンドファイル(mytest.R)を作る
sink("out.txt")
mydata <- matrix( c(4,6,3,4), nr=2)
fisher.test( mydata )
sink()
source()で読み込んで実行
> source("mytest.R")
out.txtは空っぽ。~
う〜ん、source()がこれまでと同じようには上手く動かない。~
バージョンの違い?それともウィンドウズ用との違い?
mydata と打ち込むとデータが表示されるので、読み込んではい...
ファイル入出力操作かコンソールへの表示に問題あり。
解決策:「echo=TRUE」を付けるとよさそう。((http://www.oka...
> source("mytest.R", echo=TRUE)
とすれば、ファイルに出力されるのを確認。
とりあえず、これで最低限のチェックはできた、と思う。
*2011年6月15日 [#xfb01645]
**バックグラウンドで実行 [#y03249e0]
奥村先生のページ http://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat...
nohup R CMD BATCH hoge.R &
出力は hoge.Rout にされます。
|Today:&counter(today); |Yesterday:&counter(yesterday); |...
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